Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC74

Cox18, Mitochondrial inner membrane protein COX18, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox18Q8VC74 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cox18Q8VC74 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox18Q8VC74 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms