Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BbxQ8VBW5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms