Protein–RNA interactions for Protein: Q8K387

Usp45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp45Q8K387 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp45Q8K387 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms