Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Cldn34c1Q8K193 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Cldn34c1Q8K193 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Cldn34c1Q8K193 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Cldn34c1Q8K193 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Cldn34c1Q8K193 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Cldn34c1Q8K193 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Cldn34c1Q8K193 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Cldn34c1Q8K193 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Cldn34c1Q8K193 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Cldn34c1Q8K193 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Cldn34c1Q8K193 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Cldn34c1Q8K193 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c1Q8K193 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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