Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scamp1Q8K021 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp1Q8K021 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms