Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CopaQ8CIE6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CopaQ8CIE6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms