Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms