Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufl1Q8CCJ3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms