Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SynpoQ8CC35 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SynpoQ8CC35 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SynpoQ8CC35 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SynpoQ8CC35 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SynpoQ8CC35 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SynpoQ8CC35 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SynpoQ8CC35 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SynpoQ8CC35 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SynpoQ8CC35 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SynpoQ8CC35 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SynpoQ8CC35 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SynpoQ8CC35 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SynpoQ8CC35 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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