Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
A430089I19RikQ8C9W1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms