Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C1R3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms