Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Fam53cQ8BXQ8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms