Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Iffo1Q8BXL9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Iffo1Q8BXL9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Iffo1Q8BXL9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Iffo1Q8BXL9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Iffo1Q8BXL9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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