Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp5Q8BX09 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp5Q8BX09 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms