Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx17Q8BVL3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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