Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbrm1Q8BSQ9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbrm1Q8BSQ9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pbrm1Q8BSQ9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pbrm1Q8BSQ9 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms