Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suds3Q8BR65 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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