Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup93Q8BJ71 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms