Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kdm5bQ80Y84 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm5bQ80Y84 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms