Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AknaQ80VW7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AknaQ80VW7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms