Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sbno2Q7TNB8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sbno2Q7TNB8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms