Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Shq1Q7TMX5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Shq1Q7TMX5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Shq1Q7TMX5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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