Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms