Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Topbp1Q6ZQF0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms