Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ssxb3Q6XAS4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ssxb3Q6XAS4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ssxb3Q6XAS4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ssxb3Q6XAS4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ssxb3Q6XAS4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ssxb3Q6XAS4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ssxb3Q6XAS4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ssxb3Q6XAS4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ssxb3Q6XAS4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ssxb3Q6XAS4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ssxb3Q6XAS4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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