Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nudcd1Q6PIP5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms