Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SvoplQ6PDF3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms