Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RgmaQ6PCX7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RgmaQ6PCX7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RgmaQ6PCX7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RgmaQ6PCX7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RgmaQ6PCX7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RgmaQ6PCX7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RgmaQ6PCX7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RgmaQ6PCX7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RgmaQ6PCX7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RgmaQ6PCX7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RgmaQ6PCX7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RgmaQ6PCX7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RgmaQ6PCX7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RgmaQ6PCX7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RgmaQ6PCX7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RgmaQ6PCX7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RgmaQ6PCX7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RgmaQ6PCX7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RgmaQ6PCX7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RgmaQ6PCX7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RgmaQ6PCX7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RgmaQ6PCX7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RgmaQ6PCX7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RgmaQ6PCX7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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RgmaQ6PCX7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RgmaQ6PCX7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RgmaQ6PCX7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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RgmaQ6PCX7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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RgmaQ6PCX7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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RgmaQ6PCX7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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RgmaQ6PCX7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RgmaQ6PCX7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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