Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms