Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms