Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

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Length 945 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Soga3Q6NZL0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Soga3Q6NZL0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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