Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fndc3bQ6NWW9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms