Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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NipblQ6KCD5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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NipblQ6KCD5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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NipblQ6KCD5 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NipblQ6KCD5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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