Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms