Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop58Q6DFW4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms