Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kiaa1549Q68FD9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms