Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ScxQ64124 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ScxQ64124 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms