Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3gl2Q62420 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms