Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Six3Q62233 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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