Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sin3bQ62141 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms