Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prkd1Q62101 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms