Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Odf1Q61999 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Odf1Q61999 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Odf1Q61999 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Odf1Q61999 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Odf1Q61999 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Odf1Q61999 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Odf1Q61999 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Odf1Q61999 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Odf1Q61999 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Odf1Q61999 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Odf1Q61999 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Odf1Q61999 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Odf1Q61999 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Odf1Q61999 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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