Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Klf3Q60980 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms