Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DbpQ60925 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DbpQ60925 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DbpQ60925 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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DbpQ60925 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DbpQ60925 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DbpQ60925 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DbpQ60925 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms