Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Neurod1Q60867 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms