Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samhd1Q60710 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms