Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sft2d1Q5SSN7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms