Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sun3Q5SS91 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sun3Q5SS91 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sun3Q5SS91 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Sun3Q5SS91 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sun3Q5SS91 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sun3Q5SS91 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sun3Q5SS91 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sun3Q5SS91 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sun3Q5SS91 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sun3Q5SS91 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sun3Q5SS91 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms