Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Trim41Q5NCC3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms