Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usp28Q5I043 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Usp28Q5I043 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Usp28Q5I043 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Usp28Q5I043 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Usp28Q5I043 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Usp28Q5I043 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp28Q5I043 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp28Q5I043 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp28Q5I043 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp28Q5I043 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp28Q5I043 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp28Q5I043 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp28Q5I043 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp28Q5I043 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp28Q5I043 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp28Q5I043 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp28Q5I043 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp28Q5I043 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp28Q5I043 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp28Q5I043 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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